El monitoreo de la calidad del agua es una herramienta fundamental para el manejo de los recursos hídricos, especialmente cuando su finalidad es el abastecimiento público, las fuentes de agua son sistemas altamente vulnerables, por lo tanto es necesario tomar las medidas preventivas para su conservación.
A partir del mes de Enero del 2016 AUTODEMA incorpora a sus actividades rutinarias el monitoreo de la calidad del agua de los embalses de las cuencas del rio Chili regulado y Colca – Siguas, incorporándose el monitoreo de los elementos biológicos desde Enero del 2017, basados en el principio de protección de la calidad del agua para sus diferentes usos (poblacional, energético, industria, etc).
La gestión de los recursos hídricos debe buscar una sólida comprensión del comportamiento acuático de dichos ecosistemas con la finalidad de incorporar nuevas estrategias operativas.